إستطاع بنك مصر تحقيق إنجازات بارزة في مجال ميكنة المرتبات، حيث قدم البنك حلولاً متنوعة موجهة لشركات القطاعين العام والخاص ، و تضمنت هذه الحلول منتجات تحويل المرتبات مثل بطاقات المرتبات و حسابات المرتبات .
ويحتفظ بنك مصر بالمركز الأول بين البنوك المشاركة في منظومة وزارة المالية لميكنة المرتبات منذ انطلاقها في عام 2005، وذلك للعام التاسع عشر على التوالي ، ويستحوذ البنك على حصة سوقية بلغت نحو 48% ، وبطاقات تجاوزت 2.35 مليون بطاقة مخصصة للجهات المتعاقدة مع البنك والتي تصل إلى نحو 1136 جهة حكومية .
وقد بلغ عدد شركات القطاع الخاص المتعاقدة مع البنك 5367 شركة بعدد بطاقات وصل إلى 1.5 مليون بطاقة ، إلى جانب ذلك يقدم البنك خدمات السداد الإلكتروني للضرائب والجمارك، مما يساهم في تعزيز منظومة التحول الرقمي وتسهيل العمليات المالية للشركات، وبلغت قيمة المرتبات التي تم تحويلها عبر البنك لكل من القطاعين العام والخاص ما يزيد عن 213.8 مليار جنيه.